本发明提供了一种利用微藻处理煤气化废水的系统和方法，其中，所述利用微藻处理煤气化废水的系统包括：设置有入口和出口的微藻养殖装置(1)、微藻输送装置(2)和煤气化废水处理装置(3)，所述微藻输送装置(2)的一端与所述微藻养殖装置(1)的出口相连通，所述微藻养殖装置(1)的出口设置在该微藻养殖装置(1)的下部；所述微藻输送装置(2)的另一端与煤气化废水处理装置(3)相连通，所述微藻输送装置(2)上还设置有鼓气阀门(4)和输送控制阀门(5)。采用本发明提供的利用微藻处理煤气化废水的系统对所述煤气化废水进行处理的方法既净化了煤气化废水中的氮、磷等指标，又能实现二氧化碳的转化固定减排，从而实现了煤气化废水培养微藻的资源化利用。