本发明的目的在于提供一种能调节水温，提高养殖密度的水产动物养殖方法与水产动物养殖系统。通过在第一养殖层中养殖水产动物，并从第一养殖层以下深度的水层抽水，并输送至第一养殖层，流经第一养殖层后流出，带出第一养殖层所产生的养殖固体废弃物；自第一养殖层流出的水流注入第一养殖层下方的第二养殖层，其带出的第一养殖层所产生的养殖固体废弃物供第二养殖层所养殖的水产动物作饲料之用。有效地调节第一养殖层的水温，且节能环保。