本发明涉及一种高效表达重组细菌素的基因工程菌及其构建方法和应用，所述基因工程菌是携带pET-SUMO-E50-52重组表达载体的大肠杆菌BL21(DE3)，所述基因工程菌是通过将核苷酸序列如SEQ？ID？No.1所示的细菌素E50-52基因克隆到融合表达质粒pET-SUMO上，再转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞构建的。所述基因工程菌经IPTG诱导表达，实现SUMO-E50-52融合蛋白在大肠杆菌中的表达，再利用特异性的SUMO蛋白酶对融合蛋白进行切割，可获得所述重组细菌素E50-52。本发明的重组细菌素抗菌活性及稳定性较好，且不易产生耐药性，可作为理想的抗菌药物、抗病毒药物、饲料添加剂、防腐剂、消杀剂等。