本发明公开一种IRF9在脑卒中疾病中的功能及其抑制剂的应用，属于基因的功能与应用领域。本发明以IRF9基因敲除小鼠和脑袋特异性IRF9转基因小鼠为实验对象，通过大脑中动脉缺血再灌注模型，结果表明与野生型C57小鼠对比，IRF9基因敲除小鼠脑袋梗死体积明显被抑制，神经功能也明显好转，而神经特异性IRF9转基因小鼠的梗死体积则明显增加，且神经功能明显恶化。因此，IRF9基因具有恶化神经系统功能的作用，特别是IRF9基因能够恶化脑卒中疾病的作用。针对IRF9的上述功能，提供IRF9作为脑卒中疾病治疗的药物靶标在研制脑卒中疾病药物中应用。