一种序批式电极反转微生物燃料电池，属于环境工程中污水处理及资源化技术领域。该电池包括两个对称的SBR反应器，中间有垫片用于固定交换膜；每个SBR反应器作为半电池；电动机安装在SBR反应器的顶部；厌氧阶段和缺氧阶段通过电动机带动搅拌杆搅拌；好氧阶段通过位于SBR反应器底部的曝气头进行曝气，由位于SBR反应器液位以上的排气孔进行排气；以碳材料作为电极连接外电路；通过进水口进水，出水口出水。本发明的效果和益处是以SBR反应器为半电池，运行灵活；产电菌生物膜催化阴阳极反应，降解污染物，产生电能；极室序批运行而造成电极极性反转，减缓pH梯度造成的过电势；好氧段可抑制产甲烷菌的生长，提高电能回收率；厌氧好氧段可实现对磷去除。