本发明提供了一种专用于小液量药物，且对药物活性影响最小，分离效率高的搅拌式除气的用于生物制药的电磁搅拌分离装置，它包括储液管(1)，储液管(1)的下端为锥形底(2)，锥形底(2)的下方连接有导流管(3)，导流管(3)后连接有接液盒(4)；所述的储液管(1)靠近锥形底(2)的一端的侧壁上设有凹槽(5)，所述的凹槽(5)为一条沿储液管(1)侧壁一周的环形凹槽，所述的凹槽(5)内安装有一根搅拌转子(6)；所述的储液管(1)的外周还设有一搅拌电机(7)，所述的搅拌电机(7)上的定子套在所述的搅拌转子(6)外用于驱动搅拌转子(6)沿着凹槽(5)转动。