本发明公开了一种屋顶分体机太阳能热水系统，它包括平板集热器、用于固定平板集热器的支架、水箱以及管道，所述水箱分别通过两根管道与平板集热器相连，所述水箱上设有进水管和出水管，所述在其中一根管道上设有一个循环泵，所述循环泵与光伏板相连，所述水箱上的进水管处还设置有控制部分，该控制部分是由主控制器、水处理模块和增压模块构成，所述主控制器与水处理模块相接。本发明通过循环泵进行温差循环，可以有效的减少水箱结垢的沉积，同时该分体机结构简单、安装方便、生产成本低廉、使用寿命长、不占用房屋使用面积，又能解决集热器在严寒地区集热器内部循环管路冻结、炸裂的情况发生。