本发明涉及一种具有杀菌投食清洗的太阳能鱼缸控制系统，属于鱼缸废水利用技术领域。包括鱼缸、杀菌过滤器、控制芯片、饲料放置盒、清洗器、太阳能发电单元以及静置室；所述杀菌过滤器设置有粗过滤层、细过滤层、吸附层以及杀菌室，所述杀菌室的底部内侧设置有搅拌器，所述杀菌室的外侧分别设置有紫外线发生器、明矾放置盒以及臭氧发生器；所述控制芯片连接有排污管电磁阀门、搅拌器、紫外线电磁开关、臭氧电磁开关、明矾放置电磁开关、饲料放出电磁开关、回旋电机、第一水泵以及第二水泵。本发明不仅能够对废水进行过滤杀菌消毒、能够自动控制水循环、利用太阳能产生电源、能够自动清洗，从而达到循环用水、自动投料、节约能源的目的，而且其杀菌速度快、杀菌效果好，同时使用方便。