本发明提供一种与虾夷扇贝生长性状相关的SNP位点，所述的位点为核苷酸序列为SEQ ID NO:2的IGFBP基因的1054位，其碱基为A或G；本发明还提供用于检测上述SNP位点的探针及分型引物。本发明通过对虾夷扇贝中IGFBP基因的转录序列进行测序和Clustal比对，筛查到3个SNP位点。运用高分辨率熔解曲线技术在虾夷扇贝群体中检测位点多态性，并分析位点基因型频率与扇贝生产性状间的相关性。位点C.1054A>G与虾夷扇贝壳高、壳长、体重、软体重和闭壳肌重等重要生长性状显著相关，AG型个体的上述生长性状均显著低于AA和GG型个体（P<0.05），且GG型的性状值最高。因此，在生产中可优先选择在该位点基因型为GG型的个体，作为高产扇贝选育的亲本或者进行规模养殖。
