本发明公开了一种防止海底油水混输管道腐蚀的方法及流程。包括如下步骤：将油井产出的原油输入至第一油气水三相分离器中进行油气水三相分离；经所述第一油气水三相分离器分离得到的气相进行排空，分离得到的水相进行收集，分离得到的含水油相输入至第二油气水三相分离器中进行油气水三相分离；经所述第二油气水三相分离器分离得到的气相进行排空，分离得到的水相进行收集，分离得到的含水油相经与乳状液稳定剂混合后输入至海底油水混输管道中，即可防止所述海底油水混输管道的腐蚀。本发明提供的防腐蚀方法，可使高含CO₂腐蚀性介质的海上油田采用碳钢海底管道实现油水混输，可大幅度降低海底管道投资，提高油田开发的经济效益，其方法简单，操作方便。