本发明涉及一种鱼源嗜水气单胞菌拮抗菌株及其应用，属于水产养殖技术领域。其筛选出一株鱼源嗜水气单胞菌拮抗菌株，并通过培养作为益生菌添加制剂添加入饲料或药物中。本发明为一种新型的拮抗菌，其生物活性稳定性、特异性高、对养殖鱼类和环境安全，可作为大宗淡水鱼类养殖中防治嗜水气单胞菌引起暴发性出血病的益生菌株，并可以该菌为主要菌种制备成微生物制剂。