本发明公开了一种餐厨垃圾二次废水的处理方法，是通过以下的步骤实现的：(1)将餐厨废水进行物化预处理，去除废水中的漂浮物、动植物油、油脂及SS；(2)将废水经过两级水解酸化-IC厌氧反应处理和好氧生物流离床的生化处理；(3)生化处理后的废水经絮凝沉淀进行排放，沉淀物进行浓缩、脱水干化。本发明排放的废水达到《中华人民共和国国家标准污水综合排放标准》(三级排放标准)，并且通过两级水解酸化-IC厌氧反应处理，CODcr总去除率可以达到92％以上，且中途无需进行碳源补给，保证设备正常运行。