本发明公开了一种基于SBR工艺的船式污水处理系统。它由运动子系统（船体、收缩轮）、污水处理子系统（SBR水处理装置、厌氧池、进水泵、回流泵、排泥泵、曝气泵）、动力子系统（电控柜、发电机）、控制子系统（PLC控制箱、进水阀、回流阀、排水阀）等4个子系统构成。当水体受到局部性污染时，可方便地移将污水处理系统动到污染区域，对污水进行快速、有效处理。该方法可到达消除水体局部性、突发性的污染，提高水体水质，对于维护水体水质长期稳定具有重要的现实意义与广泛的应用前景。