本发明所述的车辆空调变频控制系统及其方法，将车辆直流电源直接引入，通过空调的稳压电源直接输出一直流电给变频装置，由变频装置的多组变频器各自向空调的系统部件提供三相交流电，以驱动空调各个系统部件在变频模式下运行。实现简化车辆空调使用电源的转换流程，有效地降低能量损耗、提高电源使用效率，大大降低车辆上电源转换装置的容量和减小空调控制电路的结构。所述的电源控制模块的稳压电源直接引入车辆直流电源，稳压电源的直流电源输出端直接连接变频装置，变频装置通过异步通讯总线与主控MCU连接。变频装置至少包括二组变频器，变频器相互之间的电源输入端并联在一起，并通过共同的通讯总线与主控MCU连接。