本发明是一种系统更新方法，其包括：接收一更新指令；其次，行动通讯装置的控制单元依据更新指令将储存于行动通讯装置的储存单元的第一开机程序复制到行动通讯装置的记忆体单元；控制单元执行第一开机程序以将储存于储存单元的第一表头档及储存于一外部装置的第二表头档复制到记忆体单元；接着，执行第一比对程序以进行一比较运算，比较第一表头档所记录的第一分割资讯与第二表头档所记录的第二分割资讯；当二者不相同时，依据复制到记忆体单元的第二表头档与第一开机程序的第一分割及格式化程序重新分割及格式化储存单元；最后，将储存于外部装置的第二开机程序、第二表头档、第二通讯程序、及第二作业系统程序复制到储存单元的分割区。