本发明公开了一种燃料电池电压监测系统，包括开关网络单元、数据采集单元和控制单元，其中，还包括隔离通讯接口单元和主控制器；所述燃料电池堆划分成若单个燃料电池组；一燃料电池组与一开关网络单元，一数据采集单元，一控制单元，一隔离通讯接口单元构成一电压监测模块；燃料电池组中各单电池连接到开关网络单元，开关网络单元在控制单元的控制下逐一选通各单电池并将电压信号传送给数据采集单元，数据采集单元的输出端连接控制单元，控制单元通过隔离通讯接口单元向主控制器提供电压信号，主控制器通过隔离通讯接口单元提供控制信号给控制单元唯一选通监测模块。本发明降低了监测成本，保证了对燃料电池电压的有效监测。