本发明公开了一种换流站冷却水的处理方法及装置，其方法是，在换流阀内冷却水的主循环回路上增加由电除盐器、第二精密过滤器和旁路电导率表组成的内冷却水旁路对部分内冷却水进行处理；在换流阀的外冷却水系统中，利用超滤器加反渗透的水处理方法，去除系统中的可能引起结垢的钙镁成分和盐分，解决结垢堵塞问题等。本发明用于处理换流站冷却水可以彻底解决换流站冷却水因水质处理不当而引起的腐蚀、结垢以及堵塞问题，从而避免换流站因内冷水问题引起直流闭锁或紧急停运事故。