本发明公开了一种预防和消除造纸废水封闭循环系统中结垢的方法，包括：1）经二级生化处理后废水，采用改性粉煤灰进行吸附预处理，在常温下，边搅拌边加入改性粉煤灰，反应后进行静置沉降，取其上清液进行检测；2）经预处理后废水泵入膜分离反应器进水槽，通过加压输液泵依次送至微滤和超滤膜组件进行膜分离处理。3）微滤和超滤处理后出水经反冲洗泵送至UF出水槽，浓水回流到MF进水槽再进行微滤和超滤膜分离处理，UF出水槽水再进行反渗透处理，反渗透处理后出水完全回用于造纸车间的抄纸工段。本发明处理流程简单，操作方便，出水水质稳定，处理后的出水不但完全满足抄纸水质回用要求，而且还预防和消除了废水封闭循环系统中的结垢问题。