本发明涉及一种采用电厂粉煤灰制备的分子筛过滤的水处理系统，包括分子筛生物菌剂过滤池、分子筛曝气沉淀过滤池和养殖池，分子筛生物菌剂过滤池的出水口连接养殖池的进水口，分子筛曝气沉淀过滤池的进水口连接养殖池的排水口，分子筛生物菌剂过滤池和/或分子筛曝气沉淀过滤池中的分子筛为采用电厂粉煤灰制备的W型沸石分子筛，其硅铝比为3.2～4.8。本发明不仅能同步脱除沟域养殖水体中的氮磷，提高水体水质，且以电厂粉煤灰为原料制备分子筛，极大降低了水处理成本，对固体废物电厂粉煤灰的回收再利用还在一定程度上减少粉煤灰排放造成的环境污染和处理的成本，实现了以废治废，一举多得，适于大规模推广应用。