本发明涉及一种酸性矿井废水的治理装置，包括可渗透反应井，反应井底部铺设布水集水层，中部为混合填料生化反应与微生物燃料电池区，微生物燃料电池与反应井以同心圆结构布置，微生物燃料电池阴极由金属丝网支撑的碳布围成的筒状体构成，筒状体与反应井壁之间填充固载硫酸盐还原菌的生物质及大陶粒的混合填料，筒状体内部填充城市污水厂活性污泥作为阳极区，碳棒作为阳极插入污泥中，反应井上部铺设泌水过滤层，阴阳两极均用导线导出，外接电阻构成一个完整的电回路。本发明治理装置可原位治理酸性矿井废水，能够将酸性矿山废水有效调节pH至≥6，并有效降低重金属离子浓度。