本发明公开了一种电吸附除盐再生系统及再生工艺，涉及水处理领域，用以解决现有技术中二级电吸附模块再生比较彻底，但吸附效率较低的问题。再生系统包括：一级电吸附模块和二级电吸附模块，还包括：控制模块、一级电模块和二级电模块；二级电模块，用于使二级电吸附模块完成再生之前，处于短接状态；以及使二级电吸附模块完成再生之后，且一级电吸附模块完成再生之前，处于加电状态；一级电模块，用于使一级电吸附模块完成再生之前，处于短接状态；控制模块，用于控制一级电模块和二级电模块的短接和加电。本发明可以充分利用二级电吸附模块容量，调节一、二级电吸附模块负荷趋于更加合理，使模块运行工艺更紧凑。