本发明属于植物内生菌分离与微生物发酵工程领域，具体涉及一种粗榧生物碱的工业化生产方法。通过选取多年生粗榧的根、茎、叶作为外植体，经切条、灭菌后放入培养基中培养使其长出粗榧共生菌，然后对粗榧共生菌按照菌种不同进行分离并分别培养发酵，将发酵液浓缩后筛选以获得可代谢粗榧生物碱的菌种，并进行发酵培养，从培养产物中分离出发酵液，经醇降、抽滤和干燥即制得粗榧生物碱。本发明通过将活化后的菌种先接种到装有发酵培养基的摇瓶内培养,然后再进行四级种子罐扩大培养，使得菌种生理状况稳定，活力强，移种后能够迅速生长，在短时间内获得大量高品质的菌种，缩短了发酵时间，提高了生产效率。