本发明公开了一种修复富营养化水体的水生植物种量化评估方法，步骤：A、指标筛选：根据富营养化水体特征筛选出要调查的水体理化指标；B、野外调查：在典型区域范围内对河流或湖泊采用传统方法调查，记录样方中所有水生植物种名称，采集水样，测定水体物理指标；C、标准化无量纲化计算：按生活型将水生植物分为沉水植物、浮叶植物和挺水植物三类，按生活型计算每一物种对应的水体理化指标的标准化无纲量数据；D、赋予权重及总标准差计算：对理化指标赋予权重后计算每一物种无量纲化数据的总平均值和总标准差，E、排序及量化评估。该方法操作简便、快速、准确，满足河流、湖泊等湿地恢复，促进了湿地生态环境的高效恢复和功能群的配置。