本发明涉及一种衬垫式底泥生态修复技术，该衬垫内部填充填料，外层包装是一种网状结构，采用“连续式包装”方式。将衬垫覆盖于污染底泥上部，相邻两排衬垫之间可留出一定间隙。单个衬垫面积为0.5～50m²，厚度为0.1～50cm，俯视面为正方形、多边形、圆形等任意形状。衬垫内部所选填料本身具有吸附阻滞污染物的作用，修复底泥和上覆水体的同时可压实底泥，并防止污染底泥再悬浮，还可根据底泥污染情况和水体环境在填料上包覆，或在填料中添加可促进底泥和水体修复的药剂。该发明是一种对水体生态系统影响较小，可针对性的选择技术组合修复受污染的底泥，且不受水上交通影响的原位覆盖修复技术，并最终达到压实底泥、增大库容的目的。