本发明公开了一种生态友好型堰坝，包括坝体、绿色净化器、门库和控制系统，所述的绿色净化器设置在所述的坝体的上方，与坝体顶部之间形成水流通道；所述的门库设于河道岸边，用于容纳所述的绿色净化器；所述的控制系统与绿色净化器相连接，所述的控制系统控制所述的绿色净化器在门库和坝体顶部之间转动。还公开了一种水体净化方法，包括以下步骤：当水位超过设计水位时，将绿色净化器移入门库；当水位未超过设计水位时，将绿色净化器放置于堰坝顶部，通过绿色净化器对河流进行净化。本发明克服现有堰坝对水动力条件、水体环境、生物迁徙的负面影响，并增强堰坝的景观视觉效果。