本发明公开了改性沸石吸附去除畜禽废水微量抗生素的方法，属于废水处理技术领域。方法包括：(1)畜禽废水的生物预处理；(2)沸石改性处理；(3)畜禽废水的吸附处理等步骤。经硝酸、盐酸、硫酸改性处理后的沸石吸附处理后，畜禽废水中的四环素类抗生素的去除率分别达61.1％、90.7％与88.8％，而在同条件下天然沸石的吸附去除率仅为10.3％、12.9％与16.0％，故本方法具有工艺流程简单、便捷、投资较省、材料来源丰富、价廉易得、处理成本较低等特点。本发明可在大型畜禽养殖企业推广应用。