本发明涉及一种具有保护神经元线粒体动态平衡的功能的融合多肽及其应用。一种具有保护神经元线粒体动态平衡的功能的融合多肽，由九个精氨酸构成的进膜序列连接线粒体分裂蛋白Drp1上第三十三位到第五十五位氨基酸组成，并且线粒体分裂蛋白Drp1上第四十四位的丝氨酸修饰为磷酸化形式。本发明根据首次发现的线粒体动态平衡受损的分子机制设计了具有动态平衡受损线粒体的功能的融合多肽，经后期的实验证明，该融合多肽可有效的保护AD小鼠脑内神经元的存活，并可以改善小鼠的认知能力和记忆能力，具有作为临床药物的巨大潜力。