本发明公开了一种醇类发酵废水的处理方法。它是先去除醇类发酵废水中固型物杂质，再调节醇类发酵废水的pH值为5.0～8.0，然后按接种量为2.5～20％(v/v)接入油脂酵母种子液，发酵温度为25～35℃，发酵时间为2～5天，进行好氧发酵，发酵结束后，收集废水中的酵母菌体，废水根据排放要求进行后续处理。按照本发明的方法处理醇类发酵废水，不仅处理效率高，COD去除率高，还能免除如传统厌氧、好氧活性污泥处理方法所需的长时间菌种驯化阶段，同时生产富含油脂、蛋白、核酸、番茄红素以及其它高附加值成分的酵母菌体，只需简单常规的好氧发酵设备，无需如厌氧活性污泥法等使用昂贵复杂的工艺设备，工艺简单，成本低廉。整个发酵过程无需添加任何营养物质，发酵周期较短。