本发明涉及一种钠离子交换器废水零排放系统及废水处理工艺，属于废水处理技术领域。包括用于将含盐量>35000mg/L的废水与含盐量≤35000mg/L的废水区分开的水质分水器，水质分水器的输入端联通至钠离子交换器的输出端，水质分水器的低盐水输出端联通用于去除杂质的第一机械过滤器，第一机械过滤器联通原水池，水质分水器的高盐水输出端依次联通用于除去杂质的第二机械过滤器、用于除去废水中钙离子和镁离子的反应器、固液分离器，固液分离器联通至溶盐池，原水池及溶盐池的输出端均连通至钠离子交换器的输入端。本发明结构设计合理，工艺流程简捷，能将钠离子交换器排出的废水进行完全有效回收利用。