本发明涉及一种苏氨酸母液处理的新方法，所述方法包括向苏氨酸母液提取过程中获得的苏氨酸母液溶液中添加醇类物质降低其溶解度而析出，其余杂质通过添加复合微生物菌剂使得达到排放标准。本发明生产成本低，苏氨酸提取收率高，废水排放少，经济环保。其具有广阔的应用前景。