本发明公开了一种抽箱式污水净化系统及其使用方法，包括沉沙凼，沉沙凼与污水沟之间设置有栅栏，沉沙凼连接抽箱式净水装置的进水口，抽箱式净水装置是由多层且每层多个格子的框架构成，每个格子可插入一个箱子，箱子顶部开口、底部为网格状且底部铺网，箱子里面装有生物质灰渣填充物，抽箱式净水装置底部密封且设有出水口，出水口连接出水管道。本发明的有益效果是可以方便的对农村分散的污水进行净化处理。