本发明公开了一种污水处理厌氧膜生物反应器及膜组件复合清洗方法。本发明的膜生物反应器壳体内设置好氧反应区、厌氧反应区和回用水区。污水输入管输入的污水进入好氧反应区底部；好氧反应区气体和好氧反应后的污水输入厌氧反应区底部，厌氧反应区内设置膜组件，厌氧反应后的水通过物理脱氮除磷区进入回用水区，回用水区输出处理后的污水。本发明的污水处理器，膜组件在厌氧环境下反应，可明显降低了剩余污泥量。同时厌氧反应，可减缓膜组件污染，降低能耗、降低污泥量和污泥浓度。本发明的复合清洗方法，通过对膜组件进行回用水反冲清洗和化学加物理组合反冲清洗能更深入清洗污染层，并加快污染物的脱落速度，效果大大高于单一药物浸泡清洗。