本发明公开了一种预防煤粉自燃的快速包装系统及包装方法，包装系统包括一密闭的真空室，置于该真空室内有一包装机构，包装机构的上方设有煤粉下料口，包装机构的下方设有输送机构；真空室分别连接有真空泵和真空表；包装机构包括与下料口相接的下料袋，下料袋套接在下料口上，下料袋置于与控制机构相连的下料计量秤上。包装方法是将阻化剂按照一定比例从下料口上端添加至煤粉中，经搅拌系统装置搅拌均匀。在煤粉包装过程中开启真空泵，负压包装后输送至煤粉仓。本发明通过在煤粉中添加阻化剂后再进行负压包装，达到双重预防煤粉自燃的效果，有效地防止了煤氧复合作用，大大降低了阻化剂的用量，减少了阻燃成本，解决了煤粉包装速率慢的难题。