本发明公开了一种高盐分高氨氮制药污水的处理工艺及处理装置，具体说是一种结合四效蒸发、混凝沉淀、生物处理技术和深度处理技术的高效废水处理工艺。高浓度污水经四效蒸发处理后和低、中浓度污水分别用泵打入污水处理厂，污水首先进入混凝沉淀池进行悬浮物去除，经混凝沉淀后的污水自流进入调节水解池进行充分混合，经上述预处理后的污水进入采用“两相厌氧反应+多功能好氧反应”组合工艺的生物处理阶段。本发明的优点是：将多项废水处理先进技术有机结合起来，操作管理简单，易于控制调整；对进水水质水量的波动具有良好的适应性，尤其对高盐分高氨氮的难降解制药废水具有很好的去除效果。