本发明提出了一种基于馈线控制误差的协调控制系统及其方法，用于主动配电网中并网接入的分布式电源、储能系统优化协调运行控制；该基于馈线控制误差的协调控制系统包括电网一次系统和协调控制系统，通过基于馈线控制误差的协调控制系统根据交换功率的目标值和实测值，以及分布式电源、储能系统的目标值和实测值得出交换功率误差和分布式电源、储能系统的运行误差，从而得出分布式电源、储能系统在馈线控制误差协调控制下的功率控制值；进而对分布式电源、储能系统等进行闭环控制，从而提高分布式电源、储能系统优化运行的效果。