本发明公开一种储能系统蓄电池组内阻的在线检测方法，首先进行多频率电流充放电控制，然后采集电压电流信号，再经过数据处理，实现蓄电池组内阻的在线检测，其中所述方法以变流器工作时自身产生的不同频率的电压谐波、电流谐波作为检测信号。本发明中对蓄电池组的充放电控制不需要额外的装置，对蓄电池组的容量和性能没有任何额外的影响；不同于其他的测量方法只对蓄电池组在静态下进行测量，本发明中测量结果反应的是蓄电池组在运行中反应出的内阻的综合情况，因此结果的可信性较高。