本发明公开了一种水性含氟聚氨酯涂料及其制备方法。所说的水性含氟聚氨酯涂料，按重量份数计算，由5-8份的BayhydurXP2655、60-70份的水性羟基含氟聚氨酯树脂、0.05-0.1份的流平剂、1-10份的润湿剂、1-3份的增稠剂、0.2-1份的消泡剂、2-5份的成膜助剂、0.02-1.0份的催化剂A和20-40份的去离子水组成。该水性含氟聚氨酯涂料涂膜后具有较高的涂膜硬度、光泽和对水的接触角，使之可以使用在常规溶剂型聚氨酯涂料的传统应用领域，如汽车、木器、工业维护、塑料以及风电叶片、太阳能电池等高性能技术领域。