本发明公开了一种从淫羊藿中同时提取淫羊藿苷及宝藿苷I、II的方法，将淫羊藿植物粉碎后过筛网，加入乙醇溶液，加热回流提取，过滤获取滤液B，减压浓缩回收乙醇得初提物；将所得初提物用纯化水萃取，调PH，静置，抽滤，获得淫羊藿苷提取物；采用大孔吸附树脂对淫羊藿苷提取物进行洗脱，用乙醇进行脱洗，收集洗脱液；向洗脱液中加入药用活性碳，加热回流，降温，过滤获取滤液C；将滤液C经过模拟移动床色谱进行分离提纯并结晶，得到淫羊藿苷晶体，并收集过滤液D；将淫羊藿苷晶体干燥获得纯净的淫羊藿苷成品；向滤液D中加入吐温，用葡萄糖苷酶或纤维素酶酶解，酶解液通过大孔树脂混合填充的色谱柱进行分离纯化，得到产品宝藿苷I、II。