本发明公开了一种带通滤波的光纤激光器，包括种子源、与种子源光耦合的放大器，还包括光子晶体光纤，所述放大器包括多级，所述光子晶体光纤连接在最后一级放大器之前、次后级放大器之后，所述光子晶体光纤透过谱波长在A纳米至B纳米之间，用于抑制放大器产生的低于A纳米或高于B纳米的频谱展宽噪声。所述光子晶体光纤包括端部熔接的两段，一段的透过谱波长在850纳米至1063.5纳米之间，另一段的透过谱波长在1060纳米至1292纳米之间。本发明采用两段或多段具有不同导光波长的带隙型光子晶体光纤熔接而成，可以实现对即将进入高功率放大的信号的噪声去除，从而增大激光器经过放大后的峰值功率。