一种相干反斯托克斯拉曼散射显微系统的激光光源装置，包括：提供参量放大器泵浦光及相干反斯托克斯拉曼散射过程所需斯托克斯光的超短脉冲光纤激光器；可调谐连续光半导体激光器以及对可调谐连续光半导体激光器的输出光进行放大的光纤放大器，放大后的光作为参量放大器的种子光；对所述泵浦光和参量放大器的种子光在空间合束的光束合束器；顺次接收光束合束器光束的第一非线性晶体和第二非线性晶体，两非线性晶体分别作为种子光的参量放大器和倍频器；设置于第一非线性晶体和第二非线性晶体之间的准直聚焦器件以及第二非线性晶体之后的准直器件；设置于所述准直器件之后的低通滤波器，滤出相干反斯托克斯拉曼散射过程所需的泵浦光及斯托克斯光。