本发明涉及以甜叶菊为原料同时提取总咖啡酰奎尼酸和甜菊糖的方法，该方法是将甜叶菊用水或有机溶剂在加热、微波或超声辅助作用下对原料进行浸提，固液分离后得到甜菊糖和咖啡酰奎尼酸提取液后，然后进行萃取分离，最后经纯化后得到甜菊糖总苷和总咖啡酰奎尼酸的纯品。本发明提出在传统的甜菊糖生产工艺的基础上加上总咖啡酰奎尼酸的提取工艺，可以甜叶菊为原料同时得到甜菊糖和总咖啡酰奎尼酸两类产品，拓宽了总咖啡酰奎尼酸类物质的原料来源，用一种原料同时生产两类高附加值产品，可大大降低这两类产品的生产成本，减少资源浪费和环境污染，符合可持续发展战略的要求，具有良好的应用前景。