本发明涉及医疗器械领域，具体公开了一种大便标本收集器，所述大便标本收集器包括底板和侧壁，所述底板设有用于排出液体的通孔，所述侧壁为两个，且分别位于底板的左右两侧，所述大便标本收集器通过其侧壁固定在马桶的内部。本发明可以有效防止大便标本与尿液、痔疮或便血产生的血液、马桶内的水和消毒液等相混杂，保证了大便标本的检测质量和检测精度，提高了大便标本检测的可靠性，利用本发明可以方便大便标本的留取，使大便标本及时送检。