本发明提供了一种CLV3十二肽修饰的CdTe量子点的制备方法，包括以下步骤：采用一锅法合成CdTe量子点；采用芴甲氧羰基固相肽合成法合成CLV3十二肽，采用反向HPLC进行纯化，纯化后制得纯度大于98%的CLV3十二肽，其氨基酸序列为NH2-RTVPSGPDPLHH-COOH；采用零距离偶联法将CLV3十二肽连接到量子点CdTe的表面，从而制得CLV3十二肽修饰的CdTe量子点。采用该量子点所制备的荧光探针，以其作为具有活性功能的配体信号，对植物根端分生组织中的干细胞进行标记，为理解干细胞动态平衡维持的信号机制提供分子细胞学方面的直接证据。