本发明公开了一种抑制胃癌干细胞增殖的生物活性肽的制备方法，其包括从动物脏器中提取分离生物活性肽的步骤。本发明的方法操作简单，易于规模化和工业化生产，而且通过本发明的方法所制备的生物活性肽，能够有效的抑制胃癌干细胞增殖。