本实用新型涉及医疗设备，特别是一种外源性骨髓间充质干细胞的隔离装置，包括设有开口的填充基座，所述填充基座内部设有填充腔，所述填充腔通过开口与外界连通，所述开口处设有半透膜，所述半透膜包括用于封闭开口的分隔面。本实用新型在填充腔内填充外源性骨髓间充质干细胞后，用半透膜封闭开口、隔离细胞，并将填充基座的半透膜一侧放置于人体损伤部位周围，既保证了外源性骨髓间充质干细胞和人体自身细胞不会通过半透膜，又保证充质干细胞因子和炎症因子能自由出入，从而可以研究外源性骨髓间充质干细胞及其细胞因子在损伤部位中所发挥的修复作用。