本发明提供了一种新型的胚胎干细胞特异性标志物GM-CSFRα（粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子受体α链）及其应用。本发明以胚胎干细胞直接作为免疫原，制备的GM-CSFRα多克隆抗体或兔单克隆抗体GM-CSFRα，作为干细胞鉴定试剂，检测的特异性和灵敏度更高，且可用于胚胎干细胞的分离和活性检测。包含GM-CSFRα多克隆抗体或兔单克隆抗体GM-CSFRα的胚胎干细胞检测试剂盒除了用于鉴定胚胎干细胞全能性以外，还可同时用于检测干细胞活性，拓展了检测试剂盒的功能。