本发明公开了一种褐藻黄素的提取和纯化方法。本发明利用微波辅助提取技术，乙醇作溶剂，可实现褐藻原料中褐藻黄素的快速提取；采用液-液萃取结合柱色谱层析两步法分离工艺，可将褐藻黄素与叶绿素等杂质成分有效分离。本发明低毒安全，环境友好，使用乙醇作为提取溶剂，有效降低了有毒有机溶剂的使用量；采用微波提取方法，仅需5min即可完成提取，大大缩短了提取时间。本发明方法整个提取、纯化流程简单、快速、高效，且操作方便，易于实现规模化生产，为褐藻黄素这种极具价值的天然保健食品添加剂和生物药物资源的开发和利用奠定了基础。