本发明属于医药技术领域，具体涉及ATP合成酶β亚基在制备免疫保护剂、疫苗或抗细菌感染剂上的应用。更具体地说，涉及大肠埃希菌ATP合成酶β亚基在制备免疫保护剂、疫苗或抗细菌感染剂上的应用。本发明通过主动免疫和被动免疫试验发现大肠埃希菌ATP合成酶β亚基蛋白能够提高动物抵抗细菌，尤其是耐药细菌的能力，从而克服动物对细菌感染的问题。本发明所提供的蛋白质，比现有的主要使用抗生素作为抗细菌药物的应用上，具有更高的安全性和操作性，并保证良好的效果。