本发明涉及一种(2-(3-甲硫基-1,2,4噻二嗪)乙氧基)甲基膦酸酯类衍生物及其制备与应用。该衍生物具有通式I的结构：其中，R为氢、乙基、特戊酸甲基、异丙氧基羰基氧甲基或苄氧基羰基氧甲基；本发明还提供该衍生物的制备方法及应用。本发明的衍生物具有较高的抑制HBV活性，可作为先导化合物用于抗HBV药物的制备。