本发明公开了一种治疗更年期综合征的中药有效部位组合物及其制备方法。本发明所述中药有效部位组合物由阿魏、草果、白芍、金钱草、鸡血藤和合欢皮为原料，按照一定的重量份数组成。本发明所述中药有效部位组合物可以制备成治疗更年期综合征的药物，可以显著减轻女性由于身体发生退行性改变而引起的各种全身性病理变化，且具有无毒副作用，安全性高的优点。